Además de la guerra, Sudán sufre el avance de enfermedades que agravan la crisis humanitaria, con una alerta sanitaria por la propagación del cólera. Según la Oficina de Coordinación de Asuntos Humanitarios de las Naciones Unidas (OCHA), entre julio de 2024 y finales de mayo de 2025 se han registrado 83 mil casos de cólera, de los cuales 32 mil corresponden a 2025, con un pico en mayo pasado, y más de 2 mil muertes.